Sejak ditetapkan berdasarkan Keputusan Menteri Kehakiman dan Hak Asasi Manusia Nomor : M.05.PR.07.04 Tahun 2002 tanggal 25 September 2002 dan beroperasi sejak 04 Juli 2003 hingga kini, Kantor Imigrasi Singaraja telah dipimpin oleh 10 (sepuluh) Kepala Kantor. Dikepalai oleh Ade Rosyidin Soeratman periode tahun 2003 sampai dengan 2006 hingga I Gusti Agung Komang Artawan di periode 2018 sampai dengan 2020. Sejak tahun 2020 hingga tahun 2023 Kantor Imigrasi Singaraja dipimpin oleh Nanang Mustofa, pada bulan Januari 2023 hingga kini Kantor Imigrasi Singaraja dipimpin oleh Hendra Setiawan